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一种新的免疫信息学工具（EpiCC）评估PCV2疫苗免
作者:网站采编关键词:
摘要：使用PigMatrix表位预测工具分析了PCV2野毒株和疫苗毒株衣壳的氨基酸序列，以便在ORF2编码的蛋白质中识别可能与I类和II类猪主要组织相容性复合体猪白细胞抗原(SLA)相容的表位。使用Pi
使用PigMatrix表位预测工具分析了PCV2野毒株和疫苗毒株衣壳的氨基酸序列，以便在ORF2编码的蛋白质中识别可能与I类和II类猪主要组织相容性复合体猪白细胞抗原(SLA)相容的表位。使用PigMatrix和EpiCC算法，将纳入研究的疫苗毒株的T淋巴细胞表位含量与最近的PCV2毒株进行了比较。
本研究的目的是确定疫苗株与代表法国目前流行株的PCV2野毒株大样本之间的T细胞表位相关性评分。
2018 年至 2021 年间，从法国 14 个省的71 家养殖场收集了75株PCV2 毒株。这些野毒株主要是PCV2d（占总数的60%，45株），其次是 PCV2b（32%，24 株）和PCV2a（仅8%，6 株）（图1）。
图1 法国流行的PCV2基因型分布
以雷达图的形式报告EpiCC 评分结果（图 2），每个半径代表一种野毒株。按基因型将这些毒株进行分组，用橙色点表示每组毒株的PCV2a-PCV2b 疫苗（CircoMax? Myco）EpiCC评分，与疫苗A（黑点）和疫苗B（绿点）的EpiCC评分相比（这两种疫苗都仅基于PCV2a基因型）。给定的野毒株和疫苗株之间的共同表位越多，EpiCC得分越高，代表疫苗株的点越接近外圈。而越靠近外圈，相应疫苗提供的预期免疫覆盖率就越好。通过比较这 EpiCC评分，可以确定，对于这些野毒株，与疫苗A相比，CircoMax? Myco可提供平均35%的额外免疫覆盖率，与疫苗B相比，可提供平均30%的额外免疫覆盖率。
引 言
除了使用PCR、组织学和免疫组化等传统PCV2诊断之外，现在还有基于人工智能和免疫信息学模型的新方法，这些方法有助于改善养猪业中PCV2的控制1。
材料和方法
对于所分析的PCV2野毒株，除支原体价外还包含PCV2的两种基因型的三价疫苗的免疫覆盖率高于只含PCV2a基因型的单价疫苗。
结 论
1 Angulo J. et al. 2021. Use of a novel immunoinformatic tool (EpiCC) to determine T cell epitope coverage from different PCV2 vaccines against field European strains. ESPHM 2021
图2 以雷达图形式展示的75种法国PCV2毒株的 EpiCC评分结果（黑色：基于PCV2a基因型的疫苗 A；绿色：基于PCV2a基因型的疫苗B；橙色：包括PCV2a和PCV2b两种基因型的CircoMax? Myco)
评估了三种市售PCV2疫苗（两种疫苗基于PCV2a基因型，一种疫苗包括PCV2a和PCV2b两种基因型）的T细胞受体可识别表位与来自法国养殖场的大样本PCV2毒株表位之间的相关性。使用了表位含量比较（EpiCC）算法（EpiVax Inc, Providence, Rhode Island, USA）。
PCV2是一种非常小的环状单链DNA病毒。它是所有DNA病毒中突变率最高的，与RNA病毒相当。由于突变和重组的机制，PCV2基因组不断进化，并且这种进化仍在欧洲和世界其他地方进行。商用PCV2疫苗已经提供了对与感染相关的临床疾病的有效控制，但是多年来，田间毒株和疫苗病毒之间的遗传差距已经扩大。
文章来源：硕腾猪业
结 果
参考文献：
文章来源：《中国疫苗和免疫》 网址: http://www.zgymhmy.cn/zonghexinwen/2022/0711/2512.html