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生物学论文_2018-2020年中国部分省市猪流行性
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摘要:文章目录 1 材料与方法 1.1 材料 1.1.1 样品 1.1.2 主要试剂及仪器 1.2 方法 1.2.1 样品处理 1.2.2 引物设计与合成 1.2.3 病毒RNA提取与扩增 1.2.4 PEDV S1基因克隆与测序 1.2.5 PEDV S1基因序列比对和分
文章目录
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 样品
1.1.2 主要试剂及仪器
1.2 方法
1.2.1 样品处理
1.2.2 引物设计与合成
1.2.3 病毒RNA提取与扩增
1.2.4 PEDV S1基因克隆与测序
1.2.5 PEDV S1基因序列比对和分析
2 结 果
2.1 2018-2020年11省市猪场PEDV核酸检测结果
2.2 2018-2020年11省市猪场不同季度PEDV核酸检测结果
2.3 PEDV S1基因RT-PCR扩增与测序
2.4 PEDV S1基因序列比对分析
2.5 PEDV S1基因主要抗原位点分析
3 讨 论
4 结 论
文章摘要:【目的】调查中国规模化猪场猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的流行情况。【方法】利用RT-PCR检测方法对2018-2020年采集于全国11个省市318个规模化猪场的2 391份样品进行PEDV核酸检测,对30份阳性样品进行S1全基因扩增与测序,并利用MegAlign、Mega 7.0等软件进行分析。【结果】2018-2020年,猪场PEDV核酸阳性率分别为48.57%、10.96%和4.72%,样品PEDV核酸阳性率分别为28.97%、8.27%和7.50%,猪场和样品PEDV核酸阳性率呈现逐年下降的趋势。S1基因相似性分析显示,获得的30株毒株全部为GⅡ基因型,其中17株毒株为GⅡa基因亚型、5株毒株为GⅡb亚型、8株毒株为GⅡc亚型,GⅡa基因亚型毒株为2018-2020年流行的主要毒株类型;30株毒株S1基因序列之间核苷酸相似性为93.0%~99.5%,氨基酸相似性为91.7%~100%,其中22株毒株与2017-2018年流行的GⅡ基因型毒株相比S1氨基酸序列表现出特征性插入和缺失。【结论】本研究结果为监测和分析中国PEDV的变异和演化提供了临床数据,为猪流行性腹泻防控和疫苗研制提供了参考。
文章关键词:
论文DOI:10.16431/j.cnki.1671-7236.2022.02.003
论文分类号:S852.651
文章来源:《中国疫苗和免疫》 网址: http://www.zgymhmy.cn/qikandaodu/2022/0127/2392.html
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